Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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