Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

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Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cfap100Q80VN0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms