Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
IfnkQ7TSL0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms