Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPL9

Ddx55, ATP-dependent RNA helicase DDX55, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx55Q6ZPL9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ddx55Q6ZPL9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ddx55Q6ZPL9 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddx55Q6ZPL9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddx55Q6ZPL9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddx55Q6ZPL9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddx55Q6ZPL9 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx55Q6ZPL9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx55Q6ZPL9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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