Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Glis3Q6XP49 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Glis3Q6XP49 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Glis3Q6XP49 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Glis3Q6XP49 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Glis3Q6XP49 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Glis3Q6XP49 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms