Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Atp8b3Q6UQ17 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Atp8b3Q6UQ17 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Atp8b3Q6UQ17 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Atp8b3Q6UQ17 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Atp8b3Q6UQ17 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Atp8b3Q6UQ17 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms