Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms