Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtifQ6PEE2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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