Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms