Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp12Q6P5B0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms