Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mvb12bQ6KAU4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms