Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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CltbQ6IRU5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CltbQ6IRU5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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CltbQ6IRU5 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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CltbQ6IRU5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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CltbQ6IRU5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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CltbQ6IRU5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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CltbQ6IRU5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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CltbQ6IRU5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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CltbQ6IRU5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms