Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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