Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arhgap20Q6IFT4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms