Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usf2Q64705 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms