Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Irf4Q64287 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Irf4Q64287 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Irf4Q64287 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Irf4Q64287 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irf4Q64287 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irf4Q64287 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irf4Q64287 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irf4Q64287 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irf4Q64287 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irf4Q64287 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irf4Q64287 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irf4Q64287 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irf4Q64287 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Irf4Q64287 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Irf4Q64287 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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