Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5dQ62240 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms