Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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