Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mre11Q61216 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mre11Q61216 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mre11Q61216 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mre11Q61216 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mre11Q61216 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mre11Q61216 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mre11Q61216 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Mre11Q61216 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Mre11Q61216 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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