Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Klf3Q60980 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms