Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn3Q60764 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms