Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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