Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm1Q60636 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prdm1Q60636 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms