Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms