Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sin3aQ60520 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms