Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd5Q5VCS6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms