Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rbm27Q5SFM8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rbm27Q5SFM8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rbm27Q5SFM8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rbm27Q5SFM8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rbm27Q5SFM8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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