Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E2f8Q58FA4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms