Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc27Q3V036 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms