Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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BB287469Q3UT53 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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BB287469Q3UT53 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BB287469Q3UT53 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BB287469Q3UT53 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BB287469Q3UT53 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BB287469Q3UT53 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BB287469Q3UT53 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BB287469Q3UT53 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BB287469Q3UT53 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BB287469Q3UT53 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BB287469Q3UT53 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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