Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm28047Q3US59 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm28047Q3US59 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm28047Q3US59 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm28047Q3US59 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm28047Q3US59 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm28047Q3US59 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm28047Q3US59 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm28047Q3US59 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm28047Q3US59 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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