Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms