Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms