Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms