Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U595 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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