Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf149Q3U2C5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf149Q3U2C5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf149Q3U2C5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf149Q3U2C5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf149Q3U2C5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf149Q3U2C5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf149Q3U2C5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf149Q3U2C5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Rnf149Q3U2C5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf149Q3U2C5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms