Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U1D9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U1D9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms