Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms