Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms