Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Srsf6Q3TWW8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms