Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ctdnep1Q3TP92 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ctdnep1Q3TP92 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ctdnep1Q3TP92 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ctdnep1Q3TP92 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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