Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gtf3c3Q3TMP1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms