Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pde12Q3TIU4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pde12Q3TIU4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms