Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2afvQ3THW5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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