Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms