Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ptchd1Q14B62 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ptchd1Q14B62 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ptchd1Q14B62 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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ptchd1Q14B62 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ptchd1Q14B62 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ptchd1Q14B62 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ptchd1Q14B62 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ptchd1Q14B62 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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