Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q149G0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q149G0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q149G0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q149G0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q149G0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q149G0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q149G0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q149G0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q149G0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms