Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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VgfQ0VGU4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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VgfQ0VGU4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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VgfQ0VGU4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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VgfQ0VGU4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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VgfQ0VGU4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms