Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli2Q0VGT2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms