Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms